По набору специальностей и направлений подготовки студентов, образовательным программам и составу преподавателей ТюмГУ всегда относился к социально-гуманитарным вузам. Однако в последние годы в стратегию развития университета были внесены важные дополнения, связанные с подготовкой квалифицированных специалистов для крупнейшего в стране Западно-Сибирского нефтегазового комплекса. Своеобразной «дорожной картой» реализации нового подхода стала образовательная программа «Формирование инновационного научно-образовательного комплекса рационального природопользования в условиях интенсивного освоения природных ресурсов Западной Сибири». В соответствии с ней в университете открылись новые программы бакалавриата и магистратуры по приоритетным научным направлениям – химия нефти и газа, энергетика и энергоснабжение, нанотехнологии и новые материалы, инновационные технологии в нефтегазовой отрасли, техническая физика, биотехнология и др. В результате удельный вес инженерных, технических и естественнонаучных направлений в структуре подготовки будущих специалистов возрос до 33 процентов.

После вступления в 2003 г. России в единое европейское пространство высшего образования Тюменский государственный университет, как и другие вузы, начал переход на трехуровневую систему подготовки выпускников, первой ступенью которой является бакалавриат, второй – магистратура и третьей – аспирантура. Переход на новую систему образования проходил поэтапно: если в 2005 г были лицензированы 8 направлений подготовки бакалавров и 2 направления подготовки магистров, то к 2009 г. эти показатели составили соответственно 27 и 9 направлений, а к 2014 г. – 65 и 22 направления. В рамках трехуровневой подготовки были разработаны новые образовательные программы, методическая документация. С учетом мнения работодателей формируются компетенции выпускников

Важными принципами организации учебной работы вуза стали объединение образовательной, научной и инновационной деятельности, интеграция образовательного процесса и реального сектора экономики, социальной сферы, использование многообразных форм преподавания. С 1 сентября 2009 г. в университете стала вводиться модульно-рейтинговая система оценки успеваемости студента, предполагающая деление учебного материала на отдельные модули, усвоение которых оценивается определенным количеством баллов.

Для непрерывного наблюдения за динамикой образовательного процесса университет регулярно участвует в публичных российских и международных рейтингах деятельности вузов, проводит проверку остаточных знаний студентов с применением тестовых технологий, социологические опросы, мониторинг показателей, включающих лицензионные и аккредитационные требования, установленные Министерством образования и науки РФ. В качестве экспертов к оценке образовательных услуг ТюмГУ широко привлекаются представители профессиональных ассоциаций и научных сообществ, работодатели, абсолютное большинство которых высоко оценивает уровень квалификационной подготовки работающих у них выпускников университета.

Заслуги лучших студентов поощряются повышенными и именными стипендиями. Так, выпускница академической гимназии ТюмГУ, а затем студентка и аспирантка Института математики и компьютерных наук Анна Кружинова, победившая на 8 всероссийских и областных олимпиадах, являлась стипендиатом ученого совета университета, Губернатора Тюменской области, Ханты-Мансийского банка, Правительства РФ и четырежды Президента РФ. Стипендиатом ученого совета ТюмГУ, Губернатора Тюменской области, Правительства РФ, Фонда Потанина был студент Института государства и права Александр Кувшинов, а его сокурсник и многократный победитель студенческих олимпиад Роман Рзаев в 2015 г. стал победителем Потанинского конкурса стипендий в четвертый раз. Многие студенты-отличники получают стипендию Оксфордского российского фонда, направляются на стажировки в зарубежные университеты в рамках международного обмена, проходят практику на предприятиях международной кампании «Шлюмберже», немецко-российского ЗАО «Сибшванк», международной нефтедобывающей кампании «Тоталь» и др.

Новыми явлениями в образовательной деятельности университета стали прием и обучение студентов из других государств, международные образовательные программы двойных дипломов – российского и зарубежного, расширение количества преподаваемых иностранных языков, к которым, наряду с уже традиционными английским, немецким или французским, добавились арабский, болгарский испанский, итальянский, китайский, польский, сербский, японский и др
Так же был введен курс РиМ. Дисциплина «Россия и мир» стала стартовой площадкой для построения студентами индивидуальных образовательных траекторий и позволила начать изучение большого мира с изучения самого себя и своего места в этом мире.
После лекционного блока студенты работают в формате мастерских, осваивая вместе с исследователями ТюмГУ сложный инструментарий научных изысканий. В финале реализуют командный исследовательский проект и представляют результаты своей работы на суд ученой общественности.

В учебных планах увеличено количество часов, отводимых на исследовательскую работу студентов.
В сентябре 2017 в ТюмГУ открылось принципиально новое научно-образовательное подразделение – Школа перспективных исследований. Стратегической целью Школы является вклад в мировую дискуссию о наиболее актуальных проблемах мирового социального и гуманитарного знания и обеспечение уникального высококлассного образования для наиболее подготовленных, талантливых и мотивированных студентов из России и из-за рубежа.

Школа перспективных исследований – это портал в большой мир, как с точки зрения студенческой и преподавательской мобильности, так и с точки зрения интеллектуальной вовлеченности в важнейшие мировые дискуссии.

Иногородние первокурсники Тюменского Государственного университета рассказывают о том, как прошел их первый год жизни в Тюмени